粘土鉱物の3D構造ダウンロード

1.緒言

粘土の研究を行っているが，粘土鉱物の3D構造画像は，画像ファイルがあるのみで，3Dグラフィックに活用できるようなデータは見つからなかった． 調査をしていくと，モンモリロナイト鉱物の結晶学情報共通データ・フォーマット CIFファイルが存在した． このモンモリロナイト鉱物のCIFデータは，単位胞のデータあるため，結晶構造に変換する必要がある． そこで，本実験では，計算科学統合プラットフォーム「サイグレス」を用いて，単位胞から３D結晶構造を作成し， さらに，汎用的な化学物質の構造データであるmolファイルに出力することを試みる

2.方法

ファイル変換ソフトとして， 計算科学統合プラットフォーム「サイグレス」 を使用した．

3.結果

図１に，サイグレス上の3Dグラフィックスを示す．表１に，3Dグラフィックスの画像ファイルの一覧を示す．

4.結論

粘土鉱物のcifファイルは手に入るがcsfやmolファイルは手に入らなかったのでSIGGRESを活用することで手に入れることができた．molファイルをつかえばホームページ上で粘土鉱物の3Dグラフィックを表示できそうだ．